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HOW & WHY :NTRK融合“同病同治”——陆舜、李娟、韩博三位教授条分缕析丨理享氏界

作者:肿瘤瞭望   日期:2021/3/15 13:52:32  浏览量:7423

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编者按:随着NTRK的不同亚型、作用机制、融合家族的揭示,多种肿瘤的不同NTRK融合模式的发掘,NGS等检测技术的成熟和靶向NTRK的精准治疗药物恩曲替尼等的问世,使人类抗击肿瘤的脚步迈入跨瘤种治疗时代,NTRK检测也上升到指南中举足轻重的地位。面对NTRK融合伴侣多样化、融合断点多样化等特点,现有检测手段中应如何选择?最新的药物研究进展又将临床策略指向何方?理享氏界第八期-罕见靶点NTRK专场,上海市胸科医院陆舜教授携手四川省肿瘤医院李娟教授和山东大学齐鲁医院韩博教授,与您直击NTRK精准治疗药物进展,条分缕析现有检测手段的优劣,为临床带来更明晰的诊疗真见。

NTRK治疗进展


精准治疗时代的“同病同治”,NTRK的发现与崛起


肿瘤治疗已经步入“个体化精准治疗时代”。目前的精准治疗多为对同一癌种的不同亚型进行个体化治疗,即“同病异治”;进一步深究发病机制可知,不同的癌种间存在同种驱动基因,可就此给予相同的治疗方案,实现“同病同治”。基于分子生物标志物的治疗模式给患者生存带来极大改善,其核心源于精准诊断的发展。因此,随着NGS的普及,将有越来越多存在于不同肿瘤间的相同罕见靶点被发现,治疗方案将打破瘤种限制。


众多靶点中,NTRK在“同病同治”的发展中大放异彩。自1982年NTRK发现以来,人类先后在多种不同肿瘤中发现NTRK的身影,其中分泌性乳腺癌、婴儿纤维肉瘤为NTRK融合高频瘤种,突变频率为75%~>90%;脑胶质瘤、甲状腺癌等为低频瘤种,突变频率5%~25%;乳腺癌、肺癌、头颈部鳞癌等NTRK融合突变最为罕见,约为<1%~<5%。NTRK基因包含NTRK1、NTRK2、NTRK3三个亚型,分别参与表达TRKA、TRKB、TRKC三种结构类似、配体不同或交叉的跨膜蛋白,在与配体结合后,激活包括PI3K、MAPK等下游信号通路,影响细胞生长或增殖。



针对NTRK靶点的精准治疗,第一代TRK抑制剂恩曲替尼、拉罗替尼于2017年先后问世,二代TRK抑制剂Selitrctinb(Loxo 195)也获批用于TRK抑制剂耐药后使用,遗憾的是,目前我国暂未批准TRK抑制剂上市。作为FDA批准的首款可用于同时治疗NTRK和ROS1阳性的靶向药物,恩曲替尼有幸成为中国首个获批用于临床试验的TRK抑制剂,为国内患者带来一线希望。


一代TRK抑制剂,恩曲替尼研究进展


临床前研究显示,恩曲替尼可在低纳摩尔浓度下有效抑制NTRK和ROS1,动物体内研究进一步证实伴NTRK或ROS1融合的肿瘤细胞系可在恩曲替尼作用下迅速消退,且该药临床前血脑比为0.4-2.2,可在中枢神经系统中大量暴露,效果持久高效。


2020年ASCO公布了恩曲替尼I/II期临床研究的汇总分析结果,入选了ALKA-372-001、STARTRK-1、STARTRK-2三项临床研究。该研究评估了NTRK融合阳性、TRK抑制剂初治的成年实体瘤患者的疗效(n=74例)和所有接受恩曲替尼治疗人群的安全性(n=504例)。疗效评估人群中,有45%的患者接受了2线及以上治疗,约四分之一的患者伴随脑转移。结果显示,恩曲替尼治疗的NTRK融合阳性的实体瘤ORR可达63.5%,一线治疗ORR达80%、中位DoR暂未达到,二线三线治疗ORR亦可达到60%以上、中位DoR超过11个月,显示出对不同治疗线数患者均能持久有效。此外,存在脑转移患者的ORR达50%,中位颅内DoR 8.0个月,中位颅内PFS 8.9个月,具有不俗的颅内疾病控制效果。



2020年ESMO-Asia分析了该三项研究中恩曲替尼治疗NTRK融合阳性亚裔人群(n=11)的疗效,ORR达69.2%,中位DoR 10.4个月,中位PFS 14.9个月,颅内ORR 100%,与整体人群一致。



恩曲替尼耐受性良好,504例患者的安全性风险显示最常见的不良事件为味觉障碍、头晕、乏力,多为1-2级且可逆,目前无黑框警示信息。



另一个TRK抑制剂拉罗替尼Ⅰ/Ⅱ期临床研究综合分析数据显示(n=55),对于NTRK融合阳性的所有患者(含儿童)ORR为79%,mPFS为28.3个月,但遗憾的是,由于拉罗替尼通过P-gp转运蛋白主动转运出脑,未能得到其CNS活性的报告,其常见不良事件则为疲乏、ALT升高、咳嗽、便血,亦无药物相关5级事件。回顾基线人群,可发现恩曲替尼研究中入组排名前三的瘤种为肉瘤、NSCLC和涎腺肿瘤,多伴有脑转移;拉罗替尼研究则为甲状腺癌、涎腺肿瘤和软组织肉瘤,NTRK融合阳性率相对较高,脑转移患者较少。



因此,由于人群差异的存在,研究间的比较应审慎处理,总体而言,一代TRK抑制剂均有良好的疗效和安全性。


NTRK检测方法及经验


NTRK作用机制及融合特点


NTRK基因的三种亚型分别位于三种不同的染色体上,分别编码三种TRK蛋白。TRK蛋白是一种受体酪氨酸激酶,包含膜外受体结合区、跨膜区和细胞内激酶区,在与配体结合后发生二聚体化,使胞内酪氨酸激酶磷酸化并激活。不同的TRK蛋白具有不同的神经营养因子配体,激活不同的信号通路,其中TRKA主要激活Ras-MEK-ERK通路、TRKB主要激活PLC信号通路、TRKC主要激活PI3K-AKT信号通路,进而实现调节神经元的生长、分化和凋亡。



人类发现多种肿瘤中存在NTRK基因融合现象,进而形成融合蛋白,虽然其5’端融合伴侣多样,但酪氨酸激酶功能域持久存在,该区域的异常激活将引发细胞异常增殖、分化,造成癌变。NTRK融合在常见肿瘤中发生频率低,我国肺癌、乳腺癌NTRK融合频率仅为0.3%,在某些罕见肿瘤中极高,在婴儿纤维肉瘤NTRK融合频率可达90%以上,呈现出“大肿瘤、小突变,小肿瘤、大突变”的特点。


IHC、FISH、RT-PCR、NGS检测NTRK融合


NTRK基因融合特性更复杂,具有三种亚型分位与不同染色体、内含子区域大、GC序列丰富高、融合断点多样化等一系列特点,目前在超过20种了瘤种里发现了逾60种融合伴侣,给临床诊断带来了巨大挑战。NTRK检测主要有识别基因重排和检测融合蛋白表达两种途径,包括IHC、FISH、RT-PCR、NGS四种检测技术。


IHC基于抗原抗体反应原理,通过蛋白表达水平变化判断NTRK是否融合。IHC检测速度快,费用低,但仅能检测蛋白水平变化,无法明确融合伴侣及断裂位点,当NTRK融合阳性可正常表达TRK蛋白时,易造成假阴性结果,且该方法依赖于人工判读,对病理医生有较高的要求。目前Pan-TRK试剂盒已获批用于NTRK融合的初步筛选,但检测结果仍需NGS验证,以确定该过表达是否源于NTRK基因融合。



FISH基于切片组织通过杂交荧光技术、互补DNA或RNA检测染色体水平突变。较于IHC,FISH需要组织量小、更准确、更客观,同样周转较快。由于NTRK有三种亚型,每组融合探针只能检测一种融合方式,故全部检测需要三组不同探针,价格昂贵;同时,FISH只能提示NTRK是否融合,亦无法获得融合伴侣及融合方式,无法判断融合基因是否具有生物学功能,对分离距离较近的断裂融合难以识别,判读具有主观性,仍需要NGS进一步确认。



RT-PCR基于PCR检测,使用特定RNA序列识别肿瘤细胞RNA中已知的突变。其需要肿瘤细胞体积少,价格低,时效快,但该方法只能检测已知序列,很大程度上仅限于检测单个突变,检测结果依赖于RNA的质量,具有一定局限。



NGS检测在将NTRK融合基因碎片化后,通过探针将NTRK基因与融合基因富集,再进行测序并与人类基因组序列匹配,以获知NTRK基因与融合基因的断裂重排位置等具体信息。NGS需要的样本量少,通过直接测序获得信息、高度敏感,结果可靠,可在短时间内对多个基因进行平行测序,多重检测,通量高,一次覆盖NTRK所有亚型及常见和罕见靶点,结果全面而准确。



由此可见,较之IHC、FISH、RT-PCR,NGS覆盖所有融合基因,可以区分融合伴侣,发现新融合,因此,NGS已成为临床今后的检测方向。



NTRK分子诊断策略


在对NTRK融合的临床诊断中,往往先通过形态学分析识别肿瘤样本判断是否为NTRK融合高频肿瘤,若为NTRK融合高频肿瘤,则可以选择FISH、Pan-TRK IHC进行初步判断后再行NGS检测,或直接行NGS检测;若为NTRK融合低频肿瘤,具备NGS平台则选择NGS检测,不具备NGS平台则在Pan-TRK IHC初步检测为阳性后选择其他NGS平台检测。



2019年ESMO指南也作了类似的策略推荐,在组织形态学分析后,NTRK融合高频肿瘤可选择FISH、RT-PCR和NGS检测;NTRK融合低频肿瘤优先选择NGS检测,在NGS不可及的情况下方考虑IHC等手段初筛。



近期,诸多大panel NGS检测新型NTRK基因融合的研究陆续发布,不断探求肿瘤亚型进展机制,分析NTRK融合图谱,探索NTRK阳性患者靶向治疗的进展,将对后续临床诊断、治疗给予了更多提示。在多种检测NTRK融合的方法中,NGS以其高通量、更精确的特性成为首选的检测方法,将进一步助力发现更多NTRK基因融合类型,提高患者临床获益。


超级访谈


陆舜教授:肿瘤标本可行DNA检测或RNA检测,对于NTRK融合基因检测应作何选取?


韩博教授:目前针对NTRK融合基因更倾向于RNA检测。也有观点认为结合DNA、RNA双重检测会较单纯的DNA或RNA检测更高效,其数据的准确性,NTRK阳性检出率更高。?

 

陆舜教授:NTRK融合基因检测多通过肿瘤组织样本检测,那么正在兴起的液体检测是否可用于NTRK检测?


韩博教授:对此尚欠缺足够的数据支持,个人对此方面经验不多。根据与兄弟单位交流与临床反馈,液体检测如胸水、腹水中RNA活性更佳,可以作为一种融合基因检测的方法,在ALK等基因中已有初步运用。但值得注意的是,临床中存在一些病例的液态检测生信分析的阳性检出率可能更低,是当下亟待解决的问题。


 

陆舜教授:肿瘤的原发灶和转移灶的NTRK融合基因是否会有差异?


韩博教授:从现有报道来看,肿瘤原发灶和转移灶的NTRK融合基因不同的情况是存在的。而从病理角度而言,原发灶或转移灶的NTRK突变可能在早期已经发生,二者间差异应该不多,因目前尚欠缺数据证实,尚需进一步探索。?

 

陆舜教授:NTRK基因的三种亚型是否会影响药物疗效?


李娟教授:这一点也是我在恩曲替尼和拉罗替尼数据公布时所关注的。众所周知,NTRK基因有三种亚型,也有更多的融合搭配,但目前研究数据并未对这些亚组进行分析,相信随着TRK抑制剂研究数据的逐步揭示,我们会很快看到其中的异同,非常令人期待。?

 

陆舜教授:TRK抑制剂在NTRK融合阳性患者的二线及以上治疗的疗效毋庸置疑,在一线使用是否优选TRK抑制剂?是否可以选择免疫治疗?


李娟教授:根据目前恩曲替尼和拉罗替尼的数据可基本确立TRK抑制剂一线治疗NTRK融合阳性患者的地位,在一线人群中,恩曲替尼取得了当前最高的ORR和DoR,而后线人群疗效则不如一线,故TRK抑制剂应早期使用、一线使用。而对NTRK靶点的免疫治疗目前仍欠缺数据,需要继续探索。

 

陆舜教授:现下我们正在开展STARTRK-2研究,为一项仅入组成人患者的篮子研究,而国外的研究设计时儿童与成人均予以纳入,对此类不限制瘤种的临床研究的设计与执行有怎样的建议?


李娟教授:个人浅见,在篮子研究设计时应对儿童、成人予以区分,虽然儿童和成人具有共有的驱动基因,但儿童肿瘤患者的用药剂量、给药方式与成人是不同的,所以区分入组应该更为合理。

 

陆舜教授:我十分认同您的观点,在对STARTRK-2研究设计时,虑及儿童患者对药物的耐受程度和安全性,在最终的患者入选标准中仅纳入18岁以上的成人患者。对于儿童患者的疗效和安全性的分析,还需更严密、更谨慎的对待。


Tip:实体瘤患者可就近选择以下单位参与临床研究,获得TRK抑制剂治疗


版面编辑:洪山  责任编辑:卢宇

本内容仅供医学专业人士参考


NTRK融合

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